قدم باحثون من الأكاديمية الصينية للعلوم نموذجًا توليديًا جديدًا يعالج التحديات الرئيسية في مجال دراسة التعبير الجيني المكاني. يعتمد النموذج المسمى STADiffuser على تقنيات الانتشار العميق لإنشاء بيانات محاكاة عالية الجودة، حيث يجمع بين شبكة ترميز تشفيري تستخدم آليات الانتباه البياني مع نموذج انتشار كامن مدعوم بشبكة إزالة التشويش المكانية.
تتعامل تقنيات دراسة التعبير الجيني المكاني الحالية مع قيود عديدة منها التكاليف المرتفعة والبيانات الناقصة والدقة المحدودة، الأمر الذي يعوق توسيع استخدامها وتطبيقاتها. كما أن غياب محاكيات مرنة قادرة على توليد بيانات محاكاة عالية الدقة عرقل تطوير الأدوات الحاسوبية اللازمة لتحليل هذه البيانات.
يمكن للنموذج الجديد التعامل مع عينات متعددة والإحداثيات ثلاثية الأبعاد مع دعم شروط معرّفة من قبل المستخدم. يسهل استخدامه مهام تحليلية متنوعة منها ملء الفجوات في البيانات وزيادة دقة الصور وتوليد شرائح كاملة. كما يتيح نمط توليده إجراء تجارب حاسوبية تحسّن القدرة الإحصائية على اكتشاف الجينات ذات التعبير المختلف وتحديد الجينات المرتبطة بأنواع خلايا محددة مع التحكم الفعال في العوامل المربكة.
أثبت النموذج قدرته على التوسع ليصل إلى ملايين نقاط البيانات. نجح الفريق في بناء نموذج ثلاثي الأبعاد كامل الرؤية لخريطة مخيخ حيوان الماروسيت تضم أكثر من 20 مليون نقطة بيانات، مما يتيح دراسات تفصيلية من زوايا عرض متعددة.
التعليقات (0)
لا توجد تعليقات بعد. كن أول المعلّقين.