نشرت دورية Nature Communications دراسة تقدم نموذجًا حاسوبيًا جديدًا يعزز فهم التنوع الخلوي من خلال تحليل تسلسل الحمض النووي الريبوسومي. يعالج النموذج المسمى scE2TM مشكلة أساسية في الطرق الحالية، وهي ميلها إلى تعلم موضوعات متشابهة جدًا تفتقد معلومات بيولوجية مهمة.
يستخدم scE2TM معرفة خارجية موجهة لضمان أن يمثل كل موضوع مجموعة مميزة من الجينات. اختبره الفريق على عشرين مجموعة بيانات، فتفوق على سبع طرق متقدمة أخرى في تجميع البيانات. أظهرت معايير التقييم أن موضوعات النموذج تتمتع بتنوع أكبر واتساق أقوى مع المسارات البيولوجية المعروفة.
أظهرت التطبيقات العملية قدرة النموذج على محاكاة تأثيرات بيولوجية حقيقية. عند تطبيقه على خلايا الدم البيضاء المحفزة بالإنترفيرون، استطاع النموذج محاكاة تحولات خلوية تحاكي الاستجابات التجريبية. وفي تحليل أورام الجلد، حدد برامج جينية مرتبطة بالخلايا السرطانية وربطها بنتائج البقاء الحي للمريض.
شارك في البحث فريق من جامعات صينية وكندية وأمريكية وهونج كونج. تلقت الدراسة دعمًا من جهات بحثية متعددة بما فيها مجلس البحوث الكندي والمؤسسة الوطنية الصينية للعلوم الطبيعية.
Comments (0)
No comments yet. Be the first.